Test amplifikacji kwasu nukleinowego dla chorób przenoszonych drogą płciową

Testy amplifikacji kwasów nukleinowych, znane również jako NAT lub NAAT, są używane do identyfikacji małych ilości DNA lub RNA w testowanych próbkach. Można je zatem wykorzystać do identyfikacji bakterii, wirusów i innych patogenów, nawet gdy obecny jest materiał będący przedmiotem zainteresowania bardzo małe ilości. Jeśli chodzi o testowanie STD, dostępne są testy NAAT, które mogą wykrywać wiele różnych chorób przenoszonych drogą płciową. W rzeczywistości większość testów moczu na choroby przenoszone drogą płciową przeprowadza się przy użyciu testów amplifikacji kwasów nukleinowych.

Jak działają testy amplifikacji kwasów nukleinowych?

Istnieje kilka różnych rodzajów testów amplifikacji kwasów nukleinowych. Jednak wszystkie NAAT są oparte na tych samych zasadach. Najpierw naukowcy muszą wymyślić sekwencję kwasów nukleinowych, które chcą zidentyfikować i stworzyć sondy, które się do nich przyczepią. Następnie NAT wykorzystuje serię powtarzających się reakcji chemicznych, aby utworzyć liczne kopie DNA lub RNA, które lekarze próbują wykryć. Reakcje te selektywnie amplifikują sygnał interesujących kwasów nukleinowych w badanej próbce, aby łatwiej je było zidentyfikować. O wiele łatwiej jest znaleźć 10 000 kopii genu niż 10.

Co to ma wspólnego z testowaniem STD?

Proces amplifikacji bakteryjnych lub wirusowych kwasów nukleinowych sam w sobie nie jest testem STD. Zamiast tego, gdy ilość DNA lub RNA została zwiększona w próbce za pomocą PCR lub LCR, do wykrycia tego wykorzystuje się więcej konwencjonalnych testów. Testy te zwykle obejmują pewną formę hybrydyzacji kwasów nukleinowych. W tych testach próbka jest sondowana sztucznie wytworzoną komplementarną nicią DNA lub RNA, która została w jakiś sposób oznaczona, co ułatwia jej wykrycie. Może to pomóc w zobrazowaniu go jako blasku w ciemnym tagu, który zawiera tylko jeden bardzo konkretny element informacji identyfikacyjnych.

Testy amplifikacji kwasów nukleinowych są niezwykle użyteczne w testach STD. Pozwalają lekarzom na wykrycie patogenu STD, nawet jeśli występuje tylko bardzo mała liczba organizmów. Jest to technologia, która umożliwiła badanie moczu na choroby przenoszone drogą płciową, które wcześniej były wykrywalne tylko przez wymaz.

Ponadto, ponieważ testy amplifikacji kwasów nukleinowych są niezwykle czułe na nawet niewielkie ilości wirusowego DNA, są one bardzo ważne dla badania podaży krwi. Testy te umożliwiają wykrycie niewielkich ilości HIV i innych patogenów przenoszonych przez krew, które w innym przypadku mogłyby zostać przeoczone.

Istnieje również bez amplifikacji testy kwasów nukleinowych dostępne dla niektórych chorób przenoszonych drogą płciową, takich jak rzeżączka i chlamydia. Niesdrożone testy hybrydyzacji kwasów nukleinowych są bardziej prawdopodobne, gdy oczekuje się, że będą obecne duże ilości bakteryjnego lub wirusowego DNA (lub RNA), na przykład w wymazie z cewki moczowej lub w próbce kultury bakteryjnej. W takich okolicznościach wzmocnienie nie jest konieczne. W tych próbkach, jeśli obecne jest DNA lub RNA, powinno być obecne w wykrywalnych ilościach.

Przykład tego testu w działaniu

Testy amplifikacji kwasów nukleinowych są niezwykle czułymi metodami wykrywania obecności bakterii lub wirusów w próbce biologicznej. Jeśli chodzi o wykrywanie opryszczki narządów płciowych w bólu od osoby, która ma objawy, testy te służą jako realna alternatywa dla kultury wirusowej. Kultury wirusowe mogą być trudne do wykonania dla niektórych laboratoriów. W przeciwieństwie do testów krwi opryszczki, NAT nadal wymaga bezpośredniego określenia, czy wirus jest obecny w próbce, a nie szuka przeciwciał anty-herpes.

Wzmacnianie kwasu nukleinowego pozwoliło również na ekspansję chlamydii i rzeżączki w całym kraju. Teraz takie badania przesiewowe można teraz wykonywać na próbkach moczu zamiast wymazu z cewki moczowej lub szyjkowo-pochwowej. W związku z tym łatwo jest przetestować dużą liczbę młodych mężczyzn i kobiet w przypadku tych chorób przenoszonych drogą płciową w różnych warunkach klinicznych i nieklinicznych. Zbieranie moczu nie wymaga specjalistycznej wiedzy medycznej. Ludzie są również bardziej skłonni do siusiania w filiżance niż poddani wymazowi z narządów płciowych.

Naukowcy wykorzystali również testy amplifikacji kwasów nukleinowych, aby uzyskać więcej informacji na temat zakresu problemu bezobjawowych chorób przenoszonych drogą płciową w Stanach Zjednoczonych. Programy przesiewowe na dużą skalę oparte na NAT zostały wdrożone w wojsku, w miejskich nastolatkach, w mężczyznach uprawiających seks z mężczyznami oraz w innych grupach wysokiego ryzyka i niskiego ryzyka. Testy te pozwalają na wykrycie chorób przenoszonych drogą płciową w małych próbkach moczu lub krwi, które często są brane jako część dużych badań nad zdrowiem populacji.